Compressor 3 a également été revu en profondeur. Le logiciel intègre désormais des réglages pour produire des vidéos optimisées pour Apple TV et iPod. Cette version est annoncée comme trois fois plus rapide que son prédécesseur. Elle offre une meilleure prise en charge des ordinateurs embarquant plusieurs cores. Ainsi, sur un Mac Pro 8 Core, Compressor 3 met 6 minutes à encoder une vidéo de 10 minutes, là où la version 2.0 mettait près de 17 minutes. Le logiciel d'Apple facilité la mise en place de clusters, et gère un plus grand nombre de codecs, du MPEG-2 au H.264 en passant par Telestream Episode Pro/VC-1, WMV ou encore FLV.