Cette version 4 propose un VirtualBox Manager pour gérer plus facilement les machines virtuelles installées. Elle offre la prise en charge du format Open Virtualization Archive, permet d'allouer plus de 1,5/2 Go à une machine virtuelle 32 bits, gère l'accélération 2D sur les configurations dotées de plusieurs écrans, et se montre capable de redimensionner les images au format VDI et VHD.
Le logiciel adopte au passage un principe de fonctionnement plus modulaire. Oracle ne proposera plus qu'une seule déclinaison de sa solution de virtualisation sous licence GPL 2. Il sera possible d'ajouter par-dessus des extensions qui pourront être propriétaires.