Les bugs concernent la fonction Masquer d'InDesign avec d'autres applications actives, un problème intermittent de copier coller d'objets vectorisés depuis InDesign CS3 vers Illustrator CS3 et des plantages liés à diverses fenêtres de dialogue : enregistrement, export, création de liens, etc. Ce dernier bug toucherait plus fréquemment les Mac PowerPC que les Intel. Enfin un bug a été trouvé lors de l'impression de documents en PDF mais il est lié à Acrobat lequel sera prochainement mis à jour.