Fusion 3.1 offre notamment la prise en charge d'OpenGL 2.1 sous Windows Vista et Windows 7. Cette mouture intègre également EasyConnect, une fonctionnalité qui simplifie la gestion de l'USB entre le Mac et la ou les machines virtuelles.
Au menu également : une meilleure prise en charge de Boot Camp, la possibilité de créer des machines virtuelles dotés de 2 To de stockage (contre 950 Go précédemment).