Cette version se met aux réseaux sociaux. Il devient très facile d'exporter un document vers Flickr, Picasa ou encore Facebook. D’autre part, Pixelmator 1.6 sait importer directement des images depuis un scanner, un appareil photo ou bien un iPhone. Les outils de transformation ont également été améliorés. Enfin, l'éditeur a procédé à quelques retouches à l'interface de son logiciel.