Le succès d'iPod amène Apple à repenser son organisation interne. Ainsi, un nouveau département, dédié au seul baladeur numérique vedette, vient d'être créé. Jusqu'ici intégré à la même division que le Macintosh, iPod en est donc séparé. L'information a été annoncée par Steve Jobs dans une circulaire interne à l'entreprise. De ce fait, cela entraîne un jeu de chaises musicales à Cupertino. Jon Rubinstein, jusqu'alors vice-président du développement matériel, prend la direction de la nouvelle entité. De son côté, Timothy Cook, en charge jusqu'à maintenant des opérations et des ventes mondiales, prend la tête d'une division Mac réorganisée de fait. Enfin, Tim Bucher ne dirigera plus le développement du système, mais remplace Jon Rubinstein.